由于葉綠素本身的結構和組成特性，使葉綠素可見光的藍光(470 nm)和紅光波段(670 nm)有較強的吸收，葉綠素儀正是利用這個特性而研發。在紅光波段受藻類葉綠素彈性散射的影響，光譜反射率逐漸增加，在700 nm左右達到峰值，隨波長的增加受水分子強吸收的影響，反射率逐漸下降。在紅光波段，隨葉綠素濃度的增加，反射峰強度逐漸增加。

　　葉綠素在紅波段的反射峰強度同濃度有較好的線件相關性，其決定系數達0．982，利用葉綠素濃度同反射峰強度的相關關系，進行葉綠素濃度的反演，有較好的反演效果，其RMSE為1.944 ug·L-1。但是當葉綠素濃度達到10ug·L-1時，這種線性相關關系逐漸減弱，當葉綠素濃度達到l 000ug·L-1時，紅波段反射峰強度和葉綠素濃度則呈現較好的對數關系，決定系數達0.965。

　　葉綠素儀能儲存幾千個測量結果，包含測量數值及相關聯的植物名稱、時間及傳感器溫度（讀取關聯數據需要atLEAFSoft PRO軟件）；植物名稱長度多32個字符（顯示28個字符）。